Les ancêtres des races faisant partie des chevaux miniatures ont tous les mêmes origines. C'est un mélange de sang Shetland à divers types de chevaux plus légers.
La petite taille du cheval miniature s'est obtenue par la sélection et le croisement des plus petits individus pour chaque race.
Actuellement, il y a 3 races de chevaux miniatures dans le monde.

Le Falabella
Originaire du Sud de l'Amérique, il est issu des croisements des chevaux andalous abandonnés par les Espagnols au XVIème siècle et des petits chevaux indiens. La création de cette race revient la famille Falabella, d'où son nom.

Le cheval miniature anglais

Il provient du croisement de poneys Shetlands avec des chevaux de mines hollandais. Le Miniature Anglais est présent depuis très longtemps en Grande-Bretagne. On le retrouve en effet à la Cour Royale d'Angleterre, au XVIème siècle, où il servait à l'agrément et au plaisir des petits princes. Puis en 1865 dans un journal anglais, le "Gentleman's Magazine", où l'on parle de l'arrivée d'un petit étalon noir de 76 cm en provenance du Bengale.

Le cheval miniature américain
A la fin du XIXème siècle, des miniatures anglais, Pit ponies Hollandais et Falabella furent exportés aux Etats-Unis. Ils étaient utilisés dans les mines de charbon jusque dans les années 1950. La création du stub-book a été effectuée en 1978, la race fut donc standardisée.